Ein einzelner test konnte fast jedes virus erkennen


Ein einzelner test konnte fast jedes virus erkennen

Ein neuer Test, der praktisch jeden Virus, der Menschen und Tiere infiziert, erkannt hat, wurde von Forschern an der Washington University School of Medicine in St. Louis entwickelt, entsprechend den Ergebnissen, die in der Zeitschrift veröffentlicht wurden Genomforschung .

Der neue Test kann eine Vielzahl von Viren, einschließlich Norovirus, nachweisen.

Viele Tausende von Viren sind bekannt, um Krankheit bei Menschen und Tieren zu verursachen, und die Diagnose sie richtig kann ein langer und kostspieliger Prozess sein, mit zahlreichen Tests.

Viren, die in und auf dem menschlichen Körper auftreten, werden gemeinsam als das virome bekannt. Laut dem hochrangigen Autor Dr. Gregory Storch, dem Ruth L. Siteman Professor für Pädiatrie, in einem Prozess, der als "verbesserte virome Sequenzierung" bekannt ist, haben Forscher einen Weg entwickelt, um ein breites Netz zu werfen und "Viren, die anwesend sind, effizient zu erkennen Sehr niedrige Niveaus."

Kein Test war bisher empfindlich genug, um niedrige Virusfehler zu erkennen. Viele Tests beschränken sich darauf, nur diejenigen Viren zu erkennen, die im Verdacht stehen, für die Krankheit eines Patienten verantwortlich zu sein.

Der neue Test könnte verwendet werden, um Ausbrüche von tödlichen Viren wie Ebola, Marburg und schweres akutes respiratorisches Syndrom (SARS) sowie häufiger auftretende Viren, einschließlich Rotavirus und Norovirus, zu erkennen, die beide schwere gastrointestinale Infektionen verursachen.

Das Team erwartet, dass der Test in Fällen nützlich ist, in denen Standardtests keine Diagnose offenbaren oder wenn es nicht bekannt ist, was einen Krankheitsausbruch verursacht hat.

Test zeigt Viren, die nicht durch Standardtests erkannt wurden

Der neue Test - genannt ViroCap - wurde in Patientenproben gezeigt, um Viren zu erkennen, die nicht durch Standardtests gefunden wurden.

Die Testsequenzen und detektieren Viren mit der gleichen Sensitivität wie PCase-Tests (PCR-Tests), die in klinischen Laboratorien weit verbreitet sind und als "Goldstandard" angesehen werden.

Allerdings, während PCR-Tests können bis zu etwa 20 ähnliche Viren auf einmal zu sehen, scheint es, dass ViroCap könnte theoretisch für praktisch jeden Virus zu testen.

Um den Test zu entwickeln, zielten Forscher auf einzigartige Strecken von DNA oder RNA aus jeder bekannten Gruppe von Viren, die Menschen und Tiere infiziert: 2 Millionen einzigartige Strecken von genetischem Material in allen.

Diese Strecken werden als Sonden verwendet, um Viren in Patientenproben zu pflücken, die eine genetische Übereinstimmung haben. Das abgestimmte Virusmaterial wird dann unter Verwendung einer genetischen Sequenzierung mit hohem Durchsatz analysiert.

Das Team schlägt vor, dass, wie völlig neuartige Viren entdeckt werden, ihr genetisches Material leicht dem Test hinzugefügt werden könnte.

Die Auswertung zeigt, dass ViroCap 52% ​​effektiver ist

Die Forscher bewerteten den neuen Test, indem sie zwei Sätze von biologischen Proben - z. B. aus Blut, Hocker und Nasensekreten - von Patienten im St. Louis Kinderkrankenhaus.

Standard-Test erkannt Viren bei 10 von 14 Patienten, aber die neue Test gefunden Viren in den vier Kindern, die früheren Tests verpasst hatte.

Häufige, alltägliche Viren, die nach dem Standardtest nicht nachgewiesen wurden, waren Influenza B, eine Ursache für saisonale Grippe, Parechovirus, ein mildes Magen-Darm- und Atemvirus, Herpes-Virus-1, verantwortlich für Fieberbläschen im Mund und Varicella-Zoster-Virus Windpocken.

In einer zweiten Gruppe von Kindern mit unerklärlichen Fiebern stellte der Standardtest 8 von 11 Viren fest, aber der neue Test fand weitere sieben, darunter ein Atemwegsvirus namens humanes Adenovirus B Typ 3A, das in der Regel harmlos ist, aber bei einigen Patienten schwere Infektionen verursachen kann.

Insgesamt stieg die Anzahl der in den beiden Patientengruppen erkannten Viren von 21 von 32 - eine Steigerung von 52%.

Der neue Test ermöglicht es auch, dass Subtypen von Viren leicht identifiziert werden können, da es detaillierte genetische Informationen über verschiedene Stämme von bestimmten Viren enthält.

Zum Beispiel, während Standard-Test identifiziert ein Virus als Influenza A, die saisonale Grippe verursacht, zeigte der neue Test, dass das Virus war ein besonders harter Subtyp namens H3N2.

Die letzte Grippe-Saison, H3N2 trug zu rund 36.000 Todesfällen in den USA bei. Diese Informationen könnten zu einer effektiveren Behandlung bei Patienten wie Kleinkindern, älteren Erwachsenen und Menschen mit geschwächtem Immunsystem führen.

Study Autor Todd Wylie sagt:

Der Test ist so empfindlich, dass er auch Variantenstämme von Viren detektiert, die genetisch eng verwandt sind. Leichte genetische Variationen zwischen Viren können oft nicht durch derzeit verfügbare Tests unterschieden werden und die Fähigkeit der Ärzte, alle Varianten mit einem Test zu erkennen, erschweren."

Die entwickelte Technologie wird Wissenschaftlern und Klinikern weltweit zugunsten von Patienten und Forschung öffentlich zugänglich gemacht.

Weitere Untersuchungen sind noch erforderlich, um die Genauigkeit des Tests zu validieren, was bedeutet, dass es mehrere Jahre dauern kann, bevor es klinisch verfügbar ist, aber Wissenschaftler können die Technologie nutzen, um Viren in einer Forschungsumgebung zu studieren.

Die Autoren hoffen auch, dass es modifiziert werden könnte, um andere Krankheitserreger als Viren, wie Bakterien, Pilze und andere Mikroben, zu erkennen. Es könnte auch zeigen, Gene, die darauf hindeuten, dass ein Pathogen ist resistent gegen die Behandlung mit Antibiotika oder andere Medikamente, nach Co-Autor Kristine Wylie.

Der neue Test wird ein besseres Verständnis von solchen Viren und die Rolle, die sie spielen, um den Körper gesund zu halten.

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